La Carrera Profesional de Odontología es creada como Carrera Profesional de la Facultad de Medicina Humana, de la Universidad Nacional San Antonio Abad del Cusco, por Resolución de Asamblea Universitaria N° AU-004-98-UNSAAC del 15 de abril de 1998. Doce (12) semestres académicos y la Clínica Odontológica comienzan su funcionamiento efectivo el 01 de Octubre del 2002, con domicilio legal dentro del Campus Universitario en el Local del Centro de Atención de Salud (CUS) frente a la Facultad de Medicina Humana, en la Av. De la Cultura Nº 733, del distrito, provincia y departamento del Cusco, con autonomía académica normativa con los mismos derechos de las demás Clínicas estatales y privadas del país.